Las dos enfermedades mas temibles, que afectan a la raíz del nogal. Producidas por dos hongos, la primera ataca las raices del árbol y la segunda, principalmente el cuello de la raíz.
No todos los porta-injertos son igualmente sensibles. Actualmente se están experimentando porta-injertos mas resistentes. En principio, J. Nigra es mas resistente a Phytophtora y J. Regia es mas sensible. (ver “porta-injertos del nogal”). Un porta-injerto de gran resistencia es Pterocaryastenoptera, actualmente en estudio, que presenta poca afinidad con algunas variedades de nogal. En el futuro, seguramente la disponibilidad de nuevos porta-injertos, posibilitará la plantación de nogales, en suelos en los que en la actualidad no es aconsejable, por su excesiva humedad o por haber tenido plantaciones anteriormente. Este problema limita el empleo de plantas procedentes de multiplicación “in-vitro” que, por ser J.Regia sobre sus propias raíces, son muy sensibles.